集装箱的水取决于天气状况，海运航程的长短，货物包装材料、集装箱状况以及货物的敏感度等。真菌、霉菌、霉在相对湿度超过55%时会对货物造成损坏。
集装箱里面有水主要可分以下几种情况：
货物自带
箱体凝结
海水入浸
淡水入浸
1、货物自带
湿气或水分随货物一起被带入集装箱。举个例来说，如果一个集装箱内装了5吨的家具，家具本身就会含有大概8%到25%的湿度，根据木材类型、家具干燥处理程度的不同而有所不同。这相当于大约400-1250升的水。这里边的湿气有些就会散发到集装箱内的空气中，成为集装箱水汽凝结的一个重要来源。
2、箱体凝结
在集装箱远洋运输或存储过程中，货柜往往会经历高温气候及较强的昼夜温差变化，温度变化会在0-8摄氏度，湿度会高达98%，这就是凝露现象，当温度为30度时，空气中水含量为30.4g每平方米。当温度由30摄氏度降低到18摄氏度，水蒸气就会凝结成水滴，若是40英尺货柜则产生1000克的冷凝水，就会造成“集装箱雨”。
3、海水入浸
常在海上漂，哪能不湿箱?如果遇到大风大浪，如果恰好箱体有小损伤，如果又在甲板上，或者遭遇海上事故，落入海里，那进海水或潮湿是没跑的。这个不多说。
4、淡水入浸
箱子顶板或侧板、前板、门板、门胶条等有破损的话，下雨雪时或船舶淡水管道破裂等都会导致进水。近期台风密集，大江南北狂风暴雨，发货时更要预防进水问题。
保险对应
淡水雨淋险： 一般附加险之一，负责由于淡水(包括船上饮用水、水管漏水、船杆滴水等)、雨水以及雪溶水所造成的损失的赔偿。
受潮受热险：对被保险货物在运输过程中因气温突然变化或由于船上通风设备失灵致使船舱内水气凝结、发潮或发热所造成的损失，负责赔偿。
水渍险：又成单独海损险，是海运货物的基本险之一，只负责咸水所造成的损失，不负责淡水所造成的损失的赔偿。