控制系统：是整个洁净实验室-生物安全实验室安全运行的神经中枢。由于洁净实验室-生物安全实验室的实验对象是危险性的微生物，出于严格控制污染的原则，它要求以少的维护人员，运用化的管理维护手段，来实时监控每一个实验室中设备所处的物理环境，保证实验室运行过程中始终处于相对负压环境，防止危险性微生物外泄。
排风和通风系统
除了空气过滤和处理外，排风和通风系统也是无菌洁净实验室必备的一部分。它们确保了实验室内的新鲜空气、适当湿度和温度，并将不相关的空气和污染物排出到室外。通常，实验室设计者需要根据实验室的大小和使用情况，确保适当的空气流速和换气率。
建造洁净房架
首先，需要在实验室內部建造洁净房架，建造工作需要找到专业可靠的施工队。在建造洁净房架时，应在结构表面采用新型应力板结构和外挂外墙护板，以保证墙面的光滑度。同时，板的尺寸也应尽可能大，为运输设置预留空间，以避免板接缝处开裂。
安装门窗壁板和空气过滤器
安装门、窗、壁板和空气过滤器，关键点在于安装时的密封性。空气过滤器的过滤面积和抗卷弯度必须满足实验室的设计要求，以确保空气质量符合要求。
安装排风通风系统
需要采用合适的排风通风系统确保无菌洁净实验室负压，以及空气流动方向和空气流速等参数的控制。在安装排风通风系统时，需要确保不同区域的风机和排气管道连接正确和布置合理。