肉眼难以看清，需要借助光学显微镜或电子显微镜才能观察到的一切微小生物的总称。 [3] 微生物包括、病毒、和少数藻类等。（但有些微生物是肉眼可以看见的，像属于的蘑菇、灵芝等。）病毒是一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”，但是它的生存必须依赖于活细胞。根据存在的不同环境分为空间微生物、海洋微生物等，按照细胞结构分类分为原核微生物和真核微生物。
原核微生物包括古菌（即古）、真、放线菌、蓝、粘、立克次氏体、支原体、衣原体和螺旋体。
营养物质
1,水和无机盐
2,碳源:凡能为微生物提供生长繁殖所需碳元素的营养物质。
来源：周围环境中的有机物质，常用的有糖类、油脂、有机酸及有机酸酯和小分子醇。
作用：碳源对微生物生长代谢的作用主要为提供细胞的碳架，提供细胞生命活动所需的能量，提供合成产物的碳架。
3,氮源：凡能为微生物提供所必需氮元素的营养物质。
来源：周围环境中得有机无机含氮物质。
作用:主要用于合成蛋白质，核酸以及含氮的代谢产物。
4,能源:能为微生物生命活动提供初能源来源的营养物质或辐射能。
5,生长因子：微生物生长不可缺少的微量有机物。
微生物千姿百态，有些是腐败性的，即引起食品气味和组织结构发生不良变化。当然有些微生物是有益的，它们可用来生产如奶酪，面包，泡菜，啤酒和葡萄酒。微生物非常小，必须通过显微镜放大约1000 倍才能看到。比如中等大小的，1000个叠加在一起只有句号那么大。