无菌室也称接种室，是系统接种、纯化菌种等无菌操作的专用实验室。在微生物工作中，菌种的接种移植是一项主要操作，这项操作的特点就是要保证菌种纯种，防止杂菌的污染。在一般环境的空气中，由于存在许多尘埃和杂菌，很易造成污染，对接种工作干扰很大。
无菌实验室空气处理净化设施
1、无菌实验室必须安装有效的通风设备，其空气流向应从清洁区域流向非清洁区域，采用机械通风时，换气量应大于3次/小时。
2、无菌实验室温度应控制在15~27℃之间，湿度以控制在50%以下为宜。
3、无菌实验室入口处应分别设有人员和物料的净化设施。
在无菌操作中切勿大幅度或快速动作、拖行，以免搅动空气中尘埃微粒。
所用的器材如培养基、稀释剂配制后经湿热121℃30分钟，吸管培养皿等均应洗涤，干燥，包扎后经干热160℃2小时才能使用。
工作人员应注意自身之，须穿戴实验衣及手套后才进行实验。对于来自人类或是病毒感染之细胞株应特别小心操作，并选择适当等级之无菌操作台(至少ClassII)。操作过程中，应避免引起气溶胶类物质的产生，小心毒性药品，例如DMSO及TPA等，并避免尖锐针头之伤害等。