用药有机肥不仅减少了土壤有益微生物的种群，而且也为微生物的存活和交配获取能量和养分，从而影响了土壤肥力水平。,生物有机肥是指含有特定功能微生物和已经解毒分解（以畜禽粪便，农作物残渣和其他动植物残体为源头）的有机物质的肥料，同时具有微生物肥料和有机肥料作用。,有机肥中所含较多的有机质，是补足土壤有机质的主要来源，是土壤肥力的最重要物质基础。,土壤有机质由土壤中未分解的、半分解的有机物质残体和腐殖质组成。施入土壤中的新鲜有机肥料，在微生物作用下，分解转化成简单的化合物，同时经过生物化学的作用，又重新组合成新的、更为复杂的、比较稳定的土壤特有的大分子高聚有机化合物，为黑色或棕色的有机胶体，即腐殖质。腐殖质是土壤中稳定的有机质，对土壤肥力有重要影响。