泥鳅为底栖鱼类，喜生活于有底淤泥的静水或缓和流水域中，如湖泊、池塘、稻田、沟渠、水库等，喜中性或偏酸性的黏性土壤，适宜的生活水温为10-32℃，最适水温为22-28℃；当水温在10℃以下或30℃以上时，泥鳅活动明显减弱；水温低于5℃或高于35℃以上时，就潜入泥中停止活动。冬季，泥鳅钻入淤泥20-30厘米处越冬，到第二年春天，水温达10℃以上时，才出来活动。
泥鳅在底泥中或水的底层淤泥中活动，且喜昼伏夜出，长期在黑暗环境使其视力退化。但触须、侧线等却十分敏感，在避敌和觅食活动中起到关键作用。泥鳅除了用鳃呼吸外，还能进行肠呼吸，所以它对低溶氧的忍耐力很强。在缺水的环境中，只要泥土保持湿润，泥鳅仍可存活很长时间。泥鳅对环境的适应性很强，因而在鳅科100余种鱼类中，唯独泥鳅数量最多，分布最广。
选择向阳、进排水方便、含腐殖质适中的黏质土壤建池塘，面积为30-100平方米。池塘四周有高出水面40厘米的防逃设施，用水泥板、砖块、硬塑料板或三合土压实筑成，也可用聚乙烯网布沿池塘的四周围栏，网布下埋置硬土层，水深40-50厘米即可。池底铺20-30厘米厚的软泥。池壁要夯实并高出水面30-40厘米，比地面高20-25厘米。在池内近出水口处设一个占池面积5-10%的鱼溜（集中鱼的地方），鱼溜比池底低20-30厘米。进水口要高于水面15-25厘米。简单说就是进出水口必须设有拦鱼网。进水口、溢水口、排水口用密网布包裹，池底向排水口倾斜，并设置与排水口相连的鱼溜，其面积约为池底的5%，低于池底30-35厘米。池中投放浮萍、水葫芦等水生植物，覆盖面积约占总面积的1/4。
网箱分为苗种培育箱和成鳅养殖箱两种。苗种培育箱采用聚乙烯网布做成，面积一般为10-25平方米。成鳅养殖箱采用3米×3米的聚乙烯网片做成，网目为0.5-1厘米，面积约为50平方米。网箱可置放在池塘、河边、水渠、湖泊等水体。箱底着泥，网箱必须铺上10-15厘米的泥土或适量的水生植物。