养殖场收集污水先经过格栅池，通过人工格栅除去粗大固体杂物后进入调节池，调节池可以调节水质水量，对剧烈的水质水量波动起均化调节作用，使其浓度符合发酵要求。
污水提升进入厌氧发酵罐。污水在其中处于厌氧状态，通过厌氧菌和甲烷菌的作用下，将污水中的有机物分解为甲烷水和二氧化碳。厌氧出水进入生物好氧接触氧化池进行好氧生化处理，厌氧池水解的小分子有机物等在这里经过好氧微生物的作用进一步分解;池内安装有生物填料，池底进行曝气，好氧菌附在填料上，形成生物膜，生物膜依靠污水中的有机物提供营养，在充分曝气的条件下，消耗掉污水中的有机物，达到降低污水中有机物的目的。
接触氧化后出水经沉淀处理，自流入氧化塘，氧化塘内设置曝气设备可以对污水进一步处理，氧化塘对于浓度不高的有机污水具有很高的处理效率，同时具有去除氮、磷的效果。经过氧化塘处理，污水完全达到农用水标准。污水经过氧化塘后注入回用水池，回用水池设置了回用水泵，处理后污水的60%通过回用水泵做养殖场冲洗水。其余40%达标水从这里被提升作为农田的灌溉用水，达到全部回收利用的目的。