高新企业申报不是企业中哪一单个部门的工作，而是需要各个部门相互配合才能完成。在日常的工作中，需设立一套完整的针对于各部门工作要求的管理制度。具体可以参考以下各项指标：
一、高新企业申报工作参考指标
1、管理层人才需要制定企业在高新领域发展战略规划，建立对应的小组讨论，根据高新认定的要求拟定相关的措施，如科技成果转化的提升方向或者技术产品的收入等；
2、确定知识产权的规划，在数量和质量方面定恒，做好时间上的把控，保证在高新企业申报前能获取有效知识产权；
3、研发小组需要确立研发部门及组织管理制度的规范体系，完善研发管理流程；
4、企业要建立合理的用工机制，确保科技人员比例达标，对科研人员的管理进行系统的安排；
5、健全研发费用核算体系，清楚认知研发费用包含内容和归集办法，确保研发费用达标；
6、合理规划研发项目，制定研发目标以确保研发整体的进度，及时赶上高新企业申报时间；
7、及时准备有关部门要求提交的相关材料，材料要求逻辑性强，以防自相矛盾。
二、高新企业工作职责要求
1、企业要挑选高专业高素质的会计从业人员，这样在进行高新企业申报时才能快速理解高新技术企业的财务核算要求，避免企业财务处理方面出现问题而导致无法申报成为高新技术企业。
2、企业在确立研发项目时，要进行研发项目小组分工，明确每个人的岗位职责和目标，避免人员工作内容的冲突，确保研发活动顺利进展和研发进度的统一进行；
3、企业核算体系方面，以研发费用为例，企业需要按照工作指引的要求以单个研发活动为基本单位分别进行归集并加总计算的，要设置专门的研发费用辅助核算账目，对每个研究开发项目进行费用或资产化登记并提供相关凭证及明细表。申报企业应具有完善的财务内部控制制度，严格按照企业会计准则或相关财务会计制度的规定记载或披露财务会计信息。
4、企业要对高新企业申报要上交的材料进行整理，对一些文件要进行加盖印章，还有一些不仅需要报告，还需要凭证和单据作为证明的材料都要整理清楚。