黑豚鼠拥有黑色的耳朵、黑色的眼睛、黑色的脚趾、油光发亮的黑色毛皮，它身形短粗、头圆大、颈短、无尾、耳朵和四肢短小、眼睛明亮，耳壳薄而血管鲜红明显，上唇分裂。门齿呈弓形深入颌部，咀嚼面锐利， 能终身生长。当咬合不正时，门齿臼齿会过度生长。黑豚鼠嚼肌发达。前肢有四趾，后肢有三趾，每趾都有突起的大趾甲，趾上的爪短而锐利，不抓人，不善攀登和跳跃。脚形似豚，体长225～355mm。被毛紧贴体表。
黑豚鼠的嗅觉灵敏，常以嗅觉辨认异性和栖息领域，母豚鼠通过嗅觉来识别异窝仔。养户人员利用黑豚鼠的这种特性，在黑豚鼠仔需要并窝或需寄养时，采用特殊的方法使其辨别不清（如在刚出生的仔身上少量涂一点香水，母豚鼠就会给异窝幼豚鼠喂奶），从而使并窝或寄养获得成功。
在自然光照条件下，黑豚鼠日夜采食，两餐之间有较长的休息期。饥饿时听到饲养人员的声音特别是拿饲料的声音时会发出“吱吱”的叫声，常整群一齐尖叫。黑豚鼠愉快时能发出“啾啾”类似鸟鸣的声音。黑豚鼠属于饮食不洁的动物，如果使用的食具不得当，黑豚鼠常在食物上边吃边排便或把食物扒散、将饮水喷出。
豚鼠栖息于岩石坡、草地、林缘和沼泽。集成5～10只的小群，穴居，夜间活动，以植物性食物为食，在食物上没有特殊要求，体质强健不易生病。主要吃植物的绿色部分，以杂草（干提摩西草/苜蓿草/燕麦草/大麦草/小麦草等）为主食，喜吃青椒、生菜、圣女果等新鲜果蔬，但果蔬等含水份过高的食物不能过量喂食，容易造成豚鼠腹泻，禁食十字花科和含淀粉类的东西。