在大自然中，野生黑豚鼠是强者，它们祖祖代代生活在大自然的深山丛林、大树、竹根下或灌木丛中， 以洞为居。野生黑豚鼠由于体小力好，为了躲避豹、狼、狐、鹰、鸳等猛兽猛禽的袭击，常常只能偷偷摸摸觅食，觅食一会儿，又只能躲藏起来，肚子饿了又偷偷出来觅食；长期整日反复，便养成了昼夜行动的习性。
黑豚鼠性情非常温顺。母兔产仔或带仔时， 出于它的母性行为，捕捉时有时会主动伤人。而黑豚鼠既不会咬人，也不会抓人。它惟一的反抗就是”逃跑”。人捕捉时只发出小的叫声，抓上手后，不再发出叫声。黑豚鼠的耳朵及四肢短小，不善跳跃，也不能攀登，只要舍池、舍圈、笼舍高上40厘米，它就乖乖躲在里面。在安静的情况下，突然的响声、人与其他动物的闯人都会引起黑它的骚动和惊恐。由于它的性情温顺，许多人将它当宠物饲养。
黑豚鼠的嗅觉灵敏，常以嗅觉辨认异性和栖息领域，母豚鼠通过嗅觉来识别异窝仔。养户人员利用黑豚鼠的这种特性，在黑豚鼠仔需要并窝或需寄养时，采用特殊的方法使其辨别不清（如在刚出生的仔身上少量涂一点香水，母豚鼠就会给异窝幼豚鼠喂奶），从而使并窝或寄养获得成功。
把成年黑豚鼠饲养到性成熟的阶段后，就要选出健壮的公黑豚鼠和母黑豚鼠进行种黑豚鼠的管理，精心饲养；其余的作为商品黑豚鼠饲养和处理。为了优选种黑豚鼠，提高黑豚鼠后代纯黑种群的质量，特别要注意不能同代近亲繁殖，如果出现变种有多少就及时淘汰多少。只有不断进行提纯复壮选育，才能保持纯黑优质品种，保持黑豚鼠强壮、抗病力强的优势，并在此基础上做好种黑豚鼠的饲养管理 。