黑豚鼠拥有黑色的耳朵、黑色的眼睛、黑色的脚趾、油光发亮的黑色毛皮，它身形短粗、头圆大、颈短、无尾、耳朵和四肢短小、眼睛明亮，耳壳薄而血管鲜红明显，上唇分裂。门齿呈弓形深入颌部，咀嚼面锐利， 能终身生长。当咬合不正时，门齿臼齿会过度生长。黑豚鼠嚼肌发达。前肢有四趾，后肢有三趾，每趾都有突起的大趾甲，趾上的爪短而锐利，不抓人，不善攀登和跳跃。脚形似豚，体长225～355mm。被毛紧贴体表。
黑豚鼠喜欢安静、干燥、清洁的环境。对外界环境的变化非常敏感，遇有异常响声、震动或环境变化，或竖耳静听，惊慌失措，或乱蹦乱跳，发出很响的逃足声以”通知”它的伙伴：受惊吓的妊娠母黑豚鼠最容易流产；正在分娩的母黑豚鼠受惊吓会难产；有的会咬死初生豚仔；哺乳母豚受惊吓拒绝给豚仔吃奶；正在采食的黑豚鼠 ，受惊吓往往停止采食。对经常性搬运和扰动很不习惯，搬运、重新安置或触摸可使黑豚鼠体重在24～48小时内明显下降，情况稳定后又很快恢复。因此，保持黑豚鼠圈舍的环境安静，是养好黑豚鼠工作中最重视的问题之一。为了保持环境安静，豚舍不要与机器建立在一起，平时在舍内操作动作要轻，不要大声喧哗，不要让人群围观，不要让狗、猫等动物进入黑豚鼠场内。
黑豚鼠属哺乳纲啮齿类动物，它和家兔一样都有啃咬硬物的习惯，通常称为啮齿行为。黑豚鼠是双门齿型，门齿中的第一对牙叫“恒齿”，出生时就有，不出现换齿现象，而且不断生长。黑豚鼠必须通过啃咬硬物本能地将它磨平，使上下颌齿面吻合。黑豚鼠的这种习性常常造成笼具食具或其他设备的损坏。为了避免造成不必要的损失，可采取一些防御措施，例如常在笼中投入带叶的树枝杆，或粗硬干草等硬物任其啃咬、磨牙；修建 舍时，在笼门的边框、边缘等处，凡是能被黑豚鼠啃到的地方，都要采取必要的加固措施。当然建饲养池就可减少这些防御措施。
在自然光照条件下，黑豚鼠日夜采食，两餐之间有较长的休息期。饥饿时听到饲养人员的声音特别是拿饲料的声音时会发出“吱吱”的叫声，常整群一齐尖叫。黑豚鼠愉快时能发出“啾啾”类似鸟鸣的声音。黑豚鼠属于饮食不洁的动物，如果使用的食具不得当，黑豚鼠常在食物上边吃边排便或把食物扒散、将饮水喷出。