很多人错误的认为，清掏化粪池就是要将化粪池的污水排干，再人工清理化粪池底部的沉积物。其实，这大可不必，因为，通过污水管道流向化粪池的污水和污物，98%以上会浮在水面以上（如：所料制品、布料、粪便、头发等等）只有不到2%的污物会沉积到底部。（如：泥沙、少量金属物）。
化粪池本身就是一个收集污物，再进行降解、转化、过滤的容器。之所以要对化粪池进行清掏，是因为该容器的容量有限，要把那些常年无法降解的物质清理出来，让化粪池有足够的空间，才能起到继续收集和转化功能。
若化粪池长期不能得到有效的清理，会导致污物过多，如：头发、毛巾、塑料布和粪便、油垢相互粘接，形成固体，越积越厚，导致堵塞翻眼。这时候的清理难度就相当大了。同时会产生大量易燃和有害气体。
清理化粪池作业程序
1.用铁钩打开化粪池的盖板，再用长竹杆(8m)搅散化粪池内杂物结块层。
2.把吸粪车开到工作现场，套好吸粪胶管(5m长，备3条)放入化粪池内。
3.启动吸粪车的开关，吸出粪便直至化粪池内的化粪结块物吸完为止，防止弄脏工作现场和过往行人的衣物。
4.盖好化粪池井盖，用清水冲洗工作现场和所有工具。
5.每年清理一次，一级池清运90％，二级池清运75％，三级池硬的表面全部清运。
6.清理后，目视井内无积物浮于上面，出入口畅通，保持污水不溢出地面。
7.在化粪池井盖打开后10～15min，人不站在池边，禁止在池边点火或吸烟，以防沼气着火烧伤人
8.人勿下池工作，防止人员中毒或陷入水中。
9.化粪池井盖打开后工作员不能离开现场，清洁完毕后，随手盖好井盖，以防行人掉入井内发生意外。
化粪池清理方法方式
化粪池清理方法方式：目前市面上采取汽车抽粪和人工清掏。
汽车抽粪是用吸污车从化粪池子里吸出污水杂物运走，人工清掏是用人力一点一点掏出装入塑料袋装车运往垃圾场。
拥有各种型号的吸污车辆及配套的管道疏通设备、利用高压水射流束清洗外管道的高压清洗车及清洗室内管道的小型清洗设备。