在实际的房室系统（特别是在生理、生态、环境等系统）中,实验条件是受到限制的。首先,对系统的激励方式不能是任意的，如在生理系统的实验中，输入一般只允许是注射或点滴；其次，各个房室的状态不一定能够测量，或者测量到的数据可能很少。在这种情况下，模型的参数能不能被估计出来（得到唯一的估计值），这就是模型结构的可辨识问题。这个问题对房室模型来说十分重要。通过对实际系统的分析建立起房室模型之后，就需要根据实验条件和测量手段来判断模型是否具有可辨识性。如果不具有可辨识性，就需要重新考虑模型结构，例如对房室进行化简、归并，在新的结构下再来考察可辨识性。模型结构的真实可靠和可辨识性，是在建立模型时必须考虑到的两个方面。
房室模型主要用于系统的动力学研究，通过辨识可以估计各房室之间的物质传输速率，这些速率是重要的动力学参数，而且往往难以直接测量得到。房室模型已广泛应用于生理、药理、生态、环境、化工等领域的研究中,例如药物动力学,生理系统中各种物质（例如激素、酶等）的代谢动力学，生态循环动力学，化学动力学等。
金属模型
以钢铁材料应用最多，如各种规格的钢铁、管材、板材，有时少量的也用一些铝合金等其他金属材料。 金属模型材料的制作，主要考虑力学性能和成本等方面的因素。力学性能主要从金属材料的强度、弹性、硬度、刚度以及抗冲击拉伸的能力等方面来考虑。金属模型加工工艺主要有切削、焊接、铸造、锻造等。因实验室加工条件有限，所以金属模型工艺选择较少。
建筑模型制作的材料很多，主要分四大类：
(1)、化工类：石英玻璃、海绵、有机玻璃、三氯甲烷、油漆、UHU胶水、A胶、ABS胶板、、工程塑料、合成塑性版、泡沫板等。
(2)、植物类：木板、多层板、高密度板、竹条、纸板等
(3)、灯光类：LED灯，米泡等。
（4）、水晶内雕建筑模型 通过激光内雕、把建筑物内雕到水晶里面